重庆交通大学王牌专业有土木工程、港口航道与海岸工程、交通运输、交通工程、机械设计制造及其自动化、计算机科学与技术、物流管理、工程管理、数学与应用数学、车辆工程等。

省级一流本科专业建设点：水利水电工程、建筑学、地质工程、工程力学、通信工程、测绘工程、航海技术、汽车服务工程、轮机工程、经济学、材料物理、英语、机械电子工程、电子信息工程、给排水科学与工程、广播电视学。

重庆市特色专业：土木工程、港口航道与海岸工程、交通运输、交通工程、工程管理、机械设计制造及其自动化、材料科学与工程、物流管理、水利水电工程。

国家级特色专业：土木工程、港口航道与海岸工程、交通运输。

重庆交通大学是由重庆市人民政府和中华人民共和国交通运输部共建的一所交通特色、以工为主的多科性大学，入选国家“中西部高校基础能力建设工程”、“卓越工程师教育培养计划”、国家级大学生创新创业训练计划、国家大学生文化素质教育基地、中国政府奖学金来华留学生接收院校、全国毕业生就业典型经验高校、全国创新创业典型经验高校，教育部本科教学工作水平评估优秀学校，是“一带一路”中波大学联盟发起成员，中俄交通大学联盟核心成员。

1951年，创建西南交通专科学校。1960年，组建重庆交通学院，成都工学院土木系、四川冶金学院冶金系、武汉水运学院水工系等相继并入。2000年，学校由交通部划转重庆市管理，为省部共建高校。2006年，更名为重庆交通大学，并增列为博士授予单位。